පර්යේෂණ රුචිකත්වයන්
මම සායනික ව්‍යාධි පරීක්ෂණ, ඇල්ගොරිතම සහ මෘදුකාංග සංවර්ධනය පිළිබඳ පසුබිමක් ඇති ගාර්වන් ආයතනයේ ප්‍රවේණි පද්ධති විශ්ලේෂකයෙක්මි. ජනගහන ප්‍රවේණි විද්‍යාවේ ප්‍රවේණික තාක්ෂණ සමූහයේ ප්‍රමුඛතම පරිගණක සංවර්ධනය, මම නව ජෛව තොරතුරු මෙවලම් සංවර්ධනය කිරීමට මෙන්ම නැනෝපෝර අනුක්‍රමික යටිතල පහසුකම් සැලසුම් කිරීමට සහ සහාය දැක්වීමට මගේ අද්විතීය කුසලතා යොදමි.
මගේ පර්යේෂණ ක්ෂේත්‍රවලට ඇතුළත් වන්නේ:
-
නැනෝපෝර් සංඥා විශ්ලේෂණය
-
සායනික පරීක්ෂණ සහ ක්රම සංවර්ධනය
-
කෙටි ටැන්ඩම් පුනරාවර්තන ආබාධ
-
වෛරස් ජාන විද්යාව (HIV/SARS-Cov-2)
-
තනි සෛල අනුපිළිවෙල
-
සෘජු RNA අනුක්‍රමණය
-
ජෙනෝම එකලස් කිරීම
-
මෙතිලේෂන් හඳුනාගැනීම
-
යන්ත්‍ර/ගැඹුරු ඉගෙනීම
ප්‍රකාශන විශේෂ අවස්ථා
ෆර්ගසන්, ජේ.එම්සහ එම්ඒ ස්මිත් (2019). "SquiggleKit: නැනෝපෝර සංඥා දත්ත හැසිරවීම සඳහා මෙවලම් කට්ටලයක්." Bioinformatics 35(24): 5372-5373.
ස්මිත්, MA, T. Ersavas,JM ෆර්ගසන්, H. Liu, MC Lucas, O. Begik, L. Bojarski, K. Barton සහ EM Novoa (2020). "නැනෝපෝර අනුක්‍රමණය සහ ගැඹුරු ඉගෙනීම භාවිතා කරමින් ස්වදේශික RNA වල අණුක තීරු කේතකරණය."Genome Res 30(9): 1345-1353.
ෆර්ගසන්, ජේ.එම්, H. Gamaarachchi, T. Nguyen, A. Gollon, S. Tong, C. Aquilina-Reid, R. Bowen-James and IW Deveson (2021). "InterARTIC: SARS-CoV-2 සහ අනෙකුත් වෛරස් වල සම්පූර්ණ-ජීනෝම නැනෝපෝර අනුක්‍රමික විශ්ලේෂණය සඳහා අන්තර්ක්‍රියාකාරී වෙබ් යෙදුමකි."ජීව තොරතුරු.