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Di

Sono un bioinformatico specializzato in tecnologie genomiche, sequenziamento di nanopori in tempo reale, analisi del segnale, apprendimento automatico e hardware associato. Ho un background nello sviluppo di software e più di un decennio di esperienza nel settore della patologia.
 

Guidando lo sviluppo computazionale all'interno del gruppo di tecnologie genomiche del Center for Population Genomics presso il Garvan Institute of Medical Research, applico le mie capacità uniche per sviluppare nuovi strumenti bioinformatici, nonché per progettare e supportare l'infrastruttura di sequenziamento dei nanopori.

Le mie aree di ricerca includono:

  • Analisi del segnale dei nanopori

  • Test clinici e sviluppo di metodi

  • Disturbi della ripetizione in tandem breve

  • Genomica virale (HIV/SARS-Cov-2)

  • Sequenziamento a cella singola

  • Sequenziamento diretto dell'RNA

  • Assemblaggio del genoma

  • Rilevazione della metilazione

  • Machine/Apprendimento profondo

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Esperienza

Istituto Garvan / Analista dei sistemi genomici

giugno 2017 - PRESENTE,  Darlinghurst

Cerebro Biosystems / Co-fondatore e CTO

ottobre 2017 - PRESENTE,  Darlinghurst

Healius (assistenza sanitaria primaria) / Senior Sviluppatore software 

Dicembre 2017 - PRESENTE,  St Leonards

Istituto Garvan / Assistente di ricerca

dicembre 2016 - giugno 2017,  Darlinghurst

Programmatore di assistenza sanitaria primaria/analista

giugno 2015 - giugno 2017,  St Leonards

Patologia di Douglas Hanly Moir / Assistente di laboratorio

2011 - 2015,  Macquarie Park

Davies Campbell De Lambert/Patologia Healthscope/Assistente di laboratorio

2009-2011,  Ryde

Premi

  • 2020 - Premio poster secondo classificato - London Calling

  • 2019 - Premio Lighting talk - ABACBS/GIW

  • 2018 - Premio Palmer Innovation - Premio Garvan

  • 2017 - Premio J&J - Med Tech's Got Talent

  • 2017 - Premio Garvan: per essere andato 'al di là' nel sostenere la cultura della bioinformatica presso Garvan

  • 2017 - Premio poster in ritardo - Conferenza AGTA

Abilità

  • Linux/UNIX, BASH

  • Python, R programmazione statistica, C, AHK, SQL

  • progettazione dell'algoritmo

  • Calcolo ad alte prestazioni (SGE)

  • Bioinformatica, scienza dei dati

  • amministrazione del sistema, automazione, networking,\

  • Sistemi Informativi di Laboratorio (LIS)

Contatto
Informazione

Gruppo Tecnologie Genomiche
Centro per la Genomica della Popolazione

Istituto Garvan di ricerca medica

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