Di
Sono un bioinformatico specializzato in tecnologie genomiche, sequenziamento di nanopori in tempo reale, analisi del segnale, apprendimento automatico e hardware associato. Ho un background nello sviluppo di software e più di un decennio di esperienza nel settore della patologia.
Guidando lo sviluppo computazionale all'interno del gruppo di tecnologie genomiche del Center for Population Genomics presso il Garvan Institute of Medical Research, applico le mie capacità uniche per sviluppare nuovi strumenti bioinformatici, nonché per progettare e supportare l'infrastruttura di sequenziamento dei nanopori.
Le mie aree di ricerca includono:
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Analisi del segnale dei nanopori
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Test clinici e sviluppo di metodi
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Disturbi della ripetizione in tandem breve
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Genomica virale (HIV/SARS-Cov-2)
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Sequenziamento a cella singola
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Sequenziamento diretto dell'RNA
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Assemblaggio del genoma
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Rilevazione della metilazione
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Machine/Apprendimento profondo

Esperienza
Istituto Garvan / Analista dei sistemi genomici
giugno 2017 - PRESENTE, Darlinghurst
Cerebro Biosystems / Co-fondatore e CTO
ottobre 2017 - PRESENTE, Darlinghurst
Healius (assistenza sanitaria primaria) / Senior Sviluppatore software
Dicembre 2017 - PRESENTE, St Leonards
Istituto Garvan / Assistente di ricerca
dicembre 2016 - giugno 2017, Darlinghurst
Programmatore di assistenza sanitaria primaria/analista
giugno 2015 - giugno 2017, St Leonards
Patologia di Douglas Hanly Moir / Assistente di laboratorio
2011 - 2015, Macquarie Park
Davies Campbell De Lambert/Patologia Healthscope/Assistente di laboratorio
2009-2011, Ryde
Premi
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2020 - Premio poster secondo classificato - London Calling
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2019 - Premio Lighting talk - ABACBS/GIW
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2018 - Premio Palmer Innovation - Premio Garvan
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2017 - Premio J&J - Med Tech's Got Talent
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2017 - Premio Garvan: per essere andato 'al di là' nel sostenere la cultura della bioinformatica presso Garvan
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2017 - Premio poster in ritardo - Conferenza AGTA
Abilità
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Linux/UNIX, BASH
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Python, R programmazione statistica, C, AHK, SQL
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progettazione dell'algoritmo
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Calcolo ad alte prestazioni (SGE)
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Bioinformatica, scienza dei dati
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amministrazione del sistema, automazione, networking,\
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Sistemi Informativi di Laboratorio (LIS)