約
私はバイオインフォマティシャンであり、ゲノム技術、リアルタイム ナノポア シーケンス、シグナル分析、機械学習、および関連ハードウェアを専門としています。私はソフトウェア開発のバックグラウンドを持ち、病理学業界で 10 年以上の経験があります。
Garvan Institute of Medical Research の Center for Population Genomics の Genomic Technologies Group 内で計算開発をリードしている私は、独自のスキルを適用して新しいバイオインフォマティクス ツールを開発し、ナノポア シーケンス インフラストラクチャを設計およびサポートしています。
私の研究分野は次のとおりです。
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ナノポア信号解析
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臨床試験と方法開発
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ショートタンデムリピート障害
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ウイルスゲノミクス (HIV/SARS-Cov-2)
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シングルセルシーケンシング
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ダイレクト RNA シーケンス
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ゲノムアセンブリ
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メチル化検出
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機械・深層学習
経験
Garvan Institute / ゲノム システム アナリスト
2017 年 6 月 - 現在、 Darlinghurst
Cerebro Biosystems / 共同創業者兼 CTO
2017 年 10 月 - 現在、 ダーリングハースト
ヘリウス（一次医療）・シニア ソフトウェア開発者
2017 年 12 月 - 現在、 セント レオナルズ
ガーバン研究所 / リサーチアシスタント
2016 年 12 月 - 2017 年 6 月、 Darlinghurst
プライマリ ヘルスケア / アナリスト プログラマー
2015 年 6 月 - 2017 年 6 月、 セント レオナルズ
Douglas Hanly Moir 病理学 / 研究室補佐官
2011 年 - 2015 年、 マッコーリー パーク
Davies Campbell De Lambert/Healthscope Pathology/Lab Aide
2009-2011、 ライド
賞
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2020 - 優秀ポスター賞 - London Calling
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2019 - 照明トーク賞 - ABACBS/GIW
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2018 - パーマー イノベーション アワード - ガーバン アワード
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2017 - J&J アワード - Med Tech's Got Talent
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2017 - ガーバン賞: ガーバンのバイオインフォマティクス文化をサポートする上で「上を行く」ことに対して
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2017 - Late Breaking Poster Award - AGTA カンファレンス
スキル
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Linux/UNIX、BASH
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Python、R 統計プログラミング、C、AHK、SQL
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アルゴリズム設計
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ハイパフォーマンスコンピューティング (SGE)
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バイオインフォマティクス、データサイエンス
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システム管理、自動化、ネットワーキング、\
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検査情報システム (LIS)